W przypadku drugiego zestawu w dotychczasowej cenie pojedynczej licencji oferowane są aż 4 licencje, łącznie z roczną usługą serwisową. Oferta skierowana jest przede wszystkim do zastosowań wielkoskalowych i pozwala rozszerzyć wykorzystanie desktopowych wersji oprogramowania eCognition, tworząc pełnowymiarowe środowisko produkcyjne typu klient-serwer.
Oprogramowanie eCogniton Server umożliwia analizę zadań skierowanych z poziomu eCognition Developer lub eCognition Architect w trybie w pełni automatycznego przetwarzania wsadowego. Krajowym dystrybutorem tej aplikacji jest firma Geosystems Polska.